Grha Padmanaba, gedung baru berlantai tujuh di kompleks SMA Negeri 3 Yogyakarta, menjadi contoh modernisasi yang berhasil diterapkan tanpa merusak bangunan cagar budaya yang ada. Saat meresmikan Grha Padmanaba pada Sabtu, 17 September 2022, Gubernur DIY Sri Sultan Hamengku Buwono X menekankan pentingnya menjaga keaslian bangunan cagar budaya meski dihadapkan pada kebutuhan modernisasi. Menurut Sultan HB X, pembangunan Grha Padmanaba telah direncanakan dengan matang, sehingga tidak mengganggu struktur bangunan heritage yang telah lama dilestarikan di sekolah tersebut.
SMA Negeri 3 Yogyakarta, yang berusia 80 tahun dan berlokasi di kawasan Kotabaru, memiliki bangunan bergaya arsitektur kolonial Belanda yang telah ditetapkan sebagai cagar budaya. Grha Padmanaba dibangun sebagai bagian dari upaya sekolah untuk menambah fasilitas tanpa mengorbankan warisan sejarahnya. Ketua Panitia Pembangunan, Triyanto, menyebutkan bahwa gedung ini, yang menelan biaya sekitar Rp 17 miliar, merupakan hasil kerja keras para alumni untuk memberikan fasilitas tambahan bagi para siswa, mendukung program Merdeka Belajar, sekaligus menjaga kelestarian bangunan heritage di SMA Negeri 3 Yogyakarta.
